Japansk encephalitis (JE) skyldes infektion med Japansk Encephalitis Virus (JEV), som er et flavivirus i familie med gul febervirus. Sygdommen er udbredt i Asien og vestlige stillehavsområde. 

JEV findes primært hos grise og vandfugle, men kan overføres til mennesker af myg af arten Culex. Det er kun få procent af smittede, der udvikler hjernebetændelse. Risikoen for at udvikle hjernebetændelse stiger med alder og ses hos 1:25 voksne, men kun hos 1:200 børn, der bliver smittet. JE er en yderst alvorlig sygdom med en dødelighed på 30 % og omkring halvdelen af de overlevende har neurologiske sekvelae. Globalt forekommer der 68.000 tilfælde af japansk encephalitis, og 15.000 dødsfald årligt i endemiske lande. De fleste tilfælde hos børn under 15 år. Incidensen af japansk encephalitis hos rejsende er estimeret til 1:400.000-1.000.000 pr. måned ved ophold i endemiske områder. Der er i perioden 1973-2020 rapporteret om 88 tilfælde af japansk hjernebetændelse hos personer fra non-endemiske lande. Der er siden 1995 kun dokumenteret to tilfælde af japansk hjernebetændelse hos danske rejsende, selvom der er mere end 150.000 danske rejsende til områder med JE hvert år. 

Vaccination mod JE kan overvejes til børn over 2 måneder og voksne, som opholder sig i mere end fire uger i områder med transmission af JE. Ved intens smitteudsættelse, aktuelle udbrud eller gentagne rejser til endemiske områder kan vaccination overvejes ved kortere rejser. Der er størst risiko ved ophold i fugtige landområder med grisehold og vadefugle og udendørs aktiviteter, specielt om aftenen og natten, mens der i byområder normalt er ringe risiko. Disse anbefalinger er vejledende. 

Vaccinen indeholder inaktiveret JEV dyrket på veroceller. Til børn > 3 år og voksne omfatter primærvaccination to doser (0,5 ml) givet i.m. med 28 dages interval. Børn 1-3 år kan vaccineres med halv dosis (0,25 ml). Vaccinen er for personer i alderen 18-65 år godkendt til et fremskyndet regime, hvor der gives to doser dag 0 og 7. Dette regime anbefales kun til personer, der skal rejse mindre end 28 dage efter 1. dosis. Ved forsat risiko for JE anbefales en booster-dosis efter 1 år. Beskyttelsen efter en booster-dosis givet 12-24 måneder efter primær immunisering er 10 år.  

Det er vist, at personer, der er primærvaccineret med den tidligere anvendte japansk encephalitis-vaccine (JE-VAX), kan boostes med en enkelt dosis af den nuværende encephalitis-vaccine (Ixiaro®), helt op til 20 år efter primær vaccination ⁽⁴⁶⁵⁴⁾. Fraset allergi over for indholdsstoffer er der ingen kontraindikationer mod vaccination.